Las actividades de la Fundación Severo Ochoa cuentan con el patrocinio de la Fundación Ramón Areces y del Banco de Santander, otorgado mediante sendos convenios de colaboración.
La Fundación Severo Ochoa ha suscrito sendos Acuerdos Marco de Colaboración con el Consejo Superior de Investigaciones Científicas y la Universidad Autónoma de Madrid, instituciones de las que forma parte el Centro de Biología Molecular Severo Ochoa.

Además tiene suscritos convenios de colaboración en las siguientes entidades e instituciones:

• Convenio Ciberned
• Fundación Tatiana Pérez de Guzmán el Bueno
• Secuelas Hepatitis C - Ciber
• Electro Medical Devices S.L.
• Laboratorios HIPRA
• Convenio VECOL
• Millipore
• Feder PGC2018-098701-B-I00
• Beca Eduardo Gallego 2019
• Wylder
• Fundación Niemann Pick
• Fundación Alicia Koplowitz
• NPSuisse
• Xcell Medical Solution
• Asociación Española del Síndrome de Wolf-Hirschhorn
• Cure Alzheimer's Fund
• VII Beca Fundación Unoentrecienmil, Asociación Espanola Contra Cáncer
• Convenio Allinky Solución Inactivante Para Patógenos
• Convenio Citrin
• Convenio LETIPharma
• Sesderma
• Grupo Water

El Dr Germán de Andrés, contratado por la Fundación Severo Ochoa, dirige el proyecto de investigación: PGC2018-098701-B-100 financiado por el plan estatal de I+D+i